眼皮多层褶皱可以通过以下方法来处理：

1. 物理方法：坚持对眼睛进行热敷或者熏蒸，利用热量改善眼部微循环，增加局部的血运代谢、淋巴循环。这样可以一定程度上改善眼皮多层褶皱。
2. 外用药物：可以配合维生素E乳膏、双氯芬酸钠乳膏、生物胶等药物进行局部涂抹、按摩治疗。这些药物可以增加局部眼睑皮肤细胞的营养，改善局部眼睑皮肤下结缔组织以及局部肌肉层的活性，从而减轻褶皱的发生。
3. 填充方法：如果物理治疗和药物治疗无法明显改善多层褶皱，可以考虑填充方法。这包括胶原蛋白填充和自体脂肪填充。胶原蛋白填充适用于因年龄衰老引起的皮肤松弛。自体脂肪填充安全性较高，一般选择自身健康脂肪组织，通过抽脂手术抽取出来，经过液化注射到眼皮部位。
4. 手术治疗：如果上述方法均无法有效改善眼皮多层褶皱，可以考虑双眼皮手术。双眼皮手术能够将多余的褶皱切除，然后进行缝合，达到双眼皮效果。但需要注意的是，手术价格可能会较高，且需要一定时间恢复。

总的来说，具体采用哪种方法需要根据个人情况和医生的建议来决定。如有疑虑，建议及时就医并咨询专业医生。