肛门里面有时阵痛可能是由多种原因引起的。以下是一些可能的原因：

1. 肛裂：引起的疼痛呈周期性，多发于大便时或大便后，主要由粪便刺激，溃疡裂口扩张所致。其疼痛为阵发性灼痛或刀割样疼痛，可持续数分钟；待粪便通过后，疼痛减轻。
2. 肛窦炎：一般为肛门部微痛、坠胀，排便时因粪便压迫发炎的肛窦而致肛门部灼痛，若括约肌因受刺激而挛缩，疼痛则加剧，并向臀部及股后部放射。常伴有少量脓性或粘液性分泌物外溢、气味臭，日久可致肛周潮湿、瘙痒等不适。
3. 肛周脓肿：以胀痛为主，酿脓时疼痛呈鸡啄样。由于肛旁脓肿的发生部位、脓肿大小、致病菌和患者机体抵抗力等种种因素不同，出现的症状和体征也各有异。
4. 血栓性外痔：以坠胀、灼痛为主，表现为肛门边缘局限性肿块，质硬、光滑、晶亮、触痛明显。多由于劳累，大便时努挣或手术刺激等造成。
5. 直肠癌：这可能导致直肠部位持续性的疼痛，还可能伴有大便习惯的改变，例如大便次数增多、大便带血或黏液等。

请注意，以上只是一些可能的原因。如果肛门里面经常出现阵痛，建议及时就医，由医生进行详细的检查和诊断。