怀孕40天流产是否需要清宫，需要根据具体情况而定，主要包括以下几种情况：
1. 如果流产以后两周，做B超发现宫腔内有残留物，且残留物在一厘米以上，一般建议行清宫术。因为这种情况下口服药物治疗效果不好，难以将残留物排出。
2. 如果流产以后阴道流血持续存在，但做B超并没有发现宫腔残留，这可能是由于内膜恢复不良或存在子宫内膜炎，这种情况也需要清宫，将回声不均质的内膜组织清理出来，改善出血的症状。
3. 对于自然流产的女性，由于孕囊已经完全排出，通常不需要行清宫手术。因为在孕囊流出以后，蜕膜组织会随之剥落，很少会出现蜕膜组织残留的情况。
以上信息仅供参考，流产后是否需要清宫，应咨询专业医生的意见。
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