在专业医生的指导下，正确佩戴牙套通常不会产生明显的危害，也不会出现严重后遗症。然而，一些常见的问题和后遗症可能会出现，包括：

1. 牙周组织健康损害：佩戴牙套过程中，如果不注意口腔卫生，或牙套设计不合理，可能会引起牙龈炎和牙周炎等问题。这些病症可能导致牙龈红肿、出血、增生，严重时甚至可能导致牙槽骨吸收和牙齿松动。
2. 牙根吸收：在正畸治疗过程中，牙齿可能会发生移动，这个过程中可能会导致部分牙根的吸收。这种吸收通常较少量的，但在某些情况下可能会比较严重。牙根的吸收可能在治疗后的一段时间内被身体自行修复。
3. 牙套脸：部分患者可能在佩戴牙套期间出现面部丰满度下降，颧骨突出，脸颊及太阳穴凹陷的现象。这通常是由于佩戴牙套导致咀嚼肌萎缩所致，通常会在正畸结束后一段时间内自行恢复。

在戴牙套的过程中，要定期去医院进行牙齿的检查，以及保持口腔卫生，避免由于牙套的佩戴而引发各种口腔问题。同时，选择正规的口腔医疗机构和专业的口腔医生进行治疗是非常关键的，能够最大程度减少牙套带来的负面影响。