针对做过根管治疗的牙齿牙龈肿痛并伴有包块的情况，以下是可能的原因及处理方法：

1. 根尖周炎：这通常是感染牙髓引起的，可能在根管治疗时消毒杀菌工作不到位，导致治疗后出现局部感染，进而表现为牙龈出现小包，并可能伴有牙痛的症状。此时，可以在医生的指导下使用药物治疗，如布洛芬缓释胶囊等，并避免随意增减药物剂量，以免影响治疗效果。
2. 根尖囊肿：这通常是牙根尖的慢性炎症性肉芽组织与牙周上皮残余增生引起，如果根管治疗后由于炎症刺激导致牙龈红肿，可以遵医嘱使用药物治疗，如头孢羟氨苄胶囊等。
3. 牙周脓肿：这是发生于牙周组织中的局限性化脓性炎症，可能是病原微生物感染引起。如果根管治疗后发生牙周脓肿，也可能引起牙龈有一个小包鼓起。此时，可以在医生的指导下使用复方氯己定含漱液、阿莫西林胶囊等药物进行抗炎治疗。

以上是做过根管治疗的牙齿牙龈肿痛并有包块的可能原因及处理方法。请注意，以上内容仅供参考，如果您或他人疑似遭受了上述困扰，请及时寻求专业牙医的帮助。