肛门附近长了一个黄豆大小的疙瘩，并且伴随疼痛，可能的原因有：
1. 痔疮：痔疮是直肠末端黏膜下及肛管皮肤下静脉丛扩张屈曲所形成的静脉团，如果痔疮坎顿或者是有血栓形成，可能会引起黄豆大小的硬结和疼痛。
2. 肛瘘：肛瘘是肛门直肠脓肿破溃或切开引流后形成的迁延不愈的管腔，可能在肛门内触摸到部分管隙或外口结构，手感同黄豆大小的硬疙瘩，可伴有瘘管外口流出少量脓性、血性、粘液性分泌物，局部出现疼痛、瘙痒症状。
3. 肛周脓肿：如果肛周脓肿张力较大且出现在肛门周围，可在肛门里面触及质硬肿物，形似黄豆大小的硬疙瘩状。还会伴随疼痛加剧、红肿发热、肿胀区域可触及波动感、坐卧不宁、大便秘结、里急后重等直肠刺激症状。
以上信息仅供参考，并非专业医疗建议，具体应去医院做相关检查，明确诊断后，由专业医生制定治疗方案。
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