月经不调应该挂妇科内分泌、生殖内分泌专科或者月经病专科，同时也可以根据医院级别以及所设置的亚专科来决定挂哪一个科室。在某些医院，有中医科或中西医结合科，也可以对月经不调进行中医的望、闻、问、切，进行诊断和治疗。
月经主要是受到卵巢周期性变化而引起的子宫内膜周期性的脱落出血，同时也是一种妇科疾病，需要到妇科就诊。当出现月经不调主要是受到体内雌激素水平的变化而扰乱正常的月经，需要到妇科做查体、激素检查和超声检查，如果出现了腹部疼痛现象时，还需要做腹腔镜的检查，用于直面的观察卵巢的形状以及子宫的大小，可以对多囊卵巢综合征等妇科疾病做相应的诊断，在经过检查之后，可以在医师指导下，通过服用地屈孕酮片、黄体酮胶囊、苯甲酸雌二醇片等药物调理。
总之，对于月经不调的患者应该根据实际情况选择不同的科室。
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