药物流产后第二个月不来月经，可能有以下几种原因：
1. 再次怀孕：药物流产后，如果当月又有性生活没有采取有效的避孕措施，又怀孕了，就会出现两个月没来月经的情况。需要去医院化验是否怀孕。
2. 宫腔粘连：药物流产后如果发生宫腔感染，没有及时治疗，子宫腔粘在一起，就会出现不来月经的情况。一般还会伴有肚子疼痛。
3. 内分泌紊乱：药物流产如果对卵巢内分泌功能造成影响，导致紊乱，雌激素和孕激素不正常，就会出现不来月经的情况。需要化验性激素6项。
此外，也有可能是药物流产造成的内分泌的失调导致的不来月经，建议到医院进行检查，根据检查结果进行调经治疗。
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