检查精子的最佳时间通常是在禁欲2-7天（至少48小时以上但不超过7天）的时候。此时，精液检查的结果最科学、最准确，能更好地评估男性的生育能力和精液质量。
在这个时间段内，精液采集的完整性和质量对检测结果影响很大。如果禁欲时间过长，如超过一周甚至更久，精子逐渐失活并在输精管内解体，精液量下降，老化精子数增加，活动精子的数目和比例减少，畸形精子的比例增加。如果禁欲时间过短，如少于2天，排出的精液量相对较少，精子浓度低，精子总数少，精子活动度下降等。
另外，采集精液的时间以晨起为佳，因为那时精液的排出具有一定顺序，开头部分来自前列腺、附睾及壶腹，伴有大量精子，最后部分来自精囊。因此应收集整份精液。
需要注意的是，取精时应注意清洁，避免污染。如果无法在医院取精室采集精液者，可向医生告知情况后选择在院外（附近家中或宾馆）取精。采集精液后最好在半小时内（最长不能超过一小时）送至男科实验室，运送过程需特别注意温度变化。男性至少需进行2至3次精液检查，才能准确反映出精液质量情况，两次检查应间隔至少7天，禁欲时间尽可能与上次检查禁欲时间相同。
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