睡醒后眼睛疼痛可能是由多种原因引起的。以下是一些常见的原因：

1. 眼部疲劳：如果患者长时间使用电脑或手机等电子产品，或者长时间用眼得不到休息，可能会导致眼部疲劳，出现睡醒后眼部疼痛的症状。这种情况下，建议患者减少用眼时间，保持充足的睡眠，使眼睛得到休息。
2. 眼部干涩：如果患者眼部本身比较干涩，在睡觉时眼睛内的水分会更容易蒸发，从而导致睡醒后眼部干涩更加严重，出现疼痛的症状。患者可以使用一些人工泪液（如玻璃酸钠滴眼液、羧甲基纤维素钠滴眼液等）来帮助缓解症状。
3. 急性结膜炎：急性结膜炎是一种由细菌感染引起的眼部疾病，常见的症状包括眼睛发红、疼痛、分泌物增多等。患者可以在医生的指导下使用抗生素药物进行治疗。
4. 青光眼：青光眼在急性发作时可能导致眼部压力升高，从而引发眼睛疼痛。患者应立即就医，采取适当的治疗措施，如使用降眼压药物、前房穿刺术等。

以上是睡醒眼睛疼的可能原因，患者应根据自身情况选择合适的治疗方法，如过不适，请及时就医。