女孩子腰疼原因主要有以下几方面：1、腰部外伤：腰部肌肉扭伤、腰部肌肉劳损、腰间盘突出、椎体以及肋骨骨折导致出现腰疼症状；2、代谢系统疾病：青春期女孩甲状腺功能亢进，长期低钙饮食，不晒太阳导致骨质疏松表现为腰部疼痛；3、风湿免疫性疾病：强直性脊柱炎、系统性红斑狼疮、风湿性关节炎、类风湿关节炎表现为腰部疼痛，同时伴有发热、尿常规改变等症状，及时到医院进行风湿免疫相关检查，指标可能有所异常；4、恶性疾病：脊柱结核、膀胱占位、肾脏占位导致出现腰疼症状；5、泌尿系统疾病：膀胱炎、肾结石、输尿管结石表现为腰部疼痛；6、月经期：年长女孩子处于月经期以及月经前期，也可出现一过性腰疼症状。