腘窝疼痛的原因有很多，因为腘窝后方的结构比较多，疼痛原因有很多种。有可能是腘窝囊肿、半月板损伤，或者是腘窝软组织的肿块形成。1、腘窝囊肿：如果是形成腘窝的囊肿，但从膝关节里头长出来后，囊肿变得很大的时候，就可能压迫周围的组织，然后形成疼痛的症状；2、半月板疾病：半月板的撕裂也有可能出现疼痛，有可能是出现在膝关节后方的疼痛，甚至有可能是因为急性软骨损伤，出现这种腘窝疼痛；3、肿瘤：腘窝后方的这些软组织，肌肉组织内形成的一些肿块，包括神经，神经上长神经纤维瘤、神经鞘瘤，也可能造成腘窝后方的疼痛。一旦出现腘窝疼痛，就需要去到医院看医生，然后做一些检查，明确疼痛原因。