小便时尿道刺痛最常见于急性尿道炎，病人发生急性尿道炎时会在尿道黏膜表面形成水肿、糜烂，还会形成水疱、脓疱，破裂后会形成分泌物，病人会出现尿道刺痒、尿道刺痛和尿道口分泌物，小便时尿道刺痛可以口服以下药物进行治疗：1、阿奇霉素分散片：对于急性尿道炎引起的尿道水肿、糜烂有明显治疗效果，对于小便时尿道刺痛也有较好的疗效；2、盐酸多西环素：对支原体、衣原体感染引起的小便刺痛症状有较好的治疗效果；3、盐酸克林霉素：对表皮葡萄球菌、溶血性链球菌引起的尿道刺痛有较好的治疗效果；4、磷霉素氨丁三醇散：对多种尿路致病菌有较好的抑菌和杀菌作用；5、盐酸米诺环素：对淋球菌感染引起的尿道刺痛有较好的治疗效果。