隐球菌属包括70余个种和变种，绝大多数为新型隐球菌和格特隐球菌。隐球菌通常为条件性致病菌，大多为外源性感染，主要侵犯于免疫受损者，尤其是细胞免疫受损者，如艾滋病患者的感染率约为30%，常规服用免疫抑制剂的器官移植患者，发病率约为5%-10%，也常见于红斑性狼疮等免疫系统性疾病患者。经常熬夜或免疫功能低下的正常人群，可能也会受到感染，但几率极小。