消化内镜检查需要的时间并不长，检查时间主要决定于检查的相关准备。一般操作胃镜，几分钟即可，但与患者的疾病情况也有关，普通病人可能数分钟即可，但如果需要活检，或者是消化道出血需要止血，这些所耗费的时间会相对比较长。结肠镜检查一般十分钟左右，然后还要考虑到患者是否麻醉。麻醉的患者，麻醉前的给药时间和操作完成后的复苏时间，总时间加起来可能相对较长。