泌尿系结石对泌尿系产生梗阻，造成排尿不通畅，甚至排尿困难。严重的肾结石可能破坏肾脏功能，甚至引发肾功能减退和肾功能衰竭。临床上部分患者，尤其是出现双肾结石或双输尿管结石的患者可能产生急性肾功能衰竭，需要进行急性的透析进行救治。泌尿系结石引起的梗阻最大的危害是尿毒症，甚至可以导致患者死亡。另外，泌尿系结石患者可产生疼痛，如肾绞痛，给患者带来巨大痛苦。泌尿系结石可引起血尿，如果病情严重可能因为出血而造成休克，危害生命。