轻度脑炎的恢复时间与感染类型及患者体质有关，临床中以1周作为恢复周期。若患者体质较强壮，且无明显基础性疾病，则恢复相对较快，2周即可痊愈；若患者体质较差，合并基础疾病较多，则预后较差，可有并发症发生，恢复时间相应较长。此外，不同患者患轻度脑炎后的症状亦不同，多数患者经系统治疗，可得较好疗效。少数患者治疗后，仍有认知功能障碍、癫痫发作、长期慢性头痛等后遗症。