新生儿脑炎按病原学分，可以分为细菌性脑炎、病毒性脑炎、真菌性脑炎。因为感染原各异、临床起病情况各异、进展程度不同、病原学具体生物学特性差别都很大，所以，治疗情况也比较差异大。但是，一旦出现以下的情况，预示治疗的复杂性巨大，或预后不好。如果是出现下列的并发症，如脑软化、硬膜下积脓、脑萎缩，提示治疗效果较差。在临床上见到的新生儿脑炎，属于新生儿的常见性疾病。治疗要强调早期发现，尤其是在家里一定要注意小孩的精神反应、眼神、还有姿势、吃奶情况。一旦出现反应不好，发烧或者是拒乳等的情况，要及时就诊，能够尽可能的保证治疗效果，而且也能够使并发症发生的几率大大的减少。