复杂性肛瘘手术后使用中药泡洗是传统中医的一种特色治疗方法，目前已经沿用了几百甚至上千年，此种方法现在仍然得到较广的使用。不同病人根据自身的体质，可能需要配置相应的药物。一般科室主张泡药物5-10分钟。如果病人感觉到舒适，也可以灵活进行掌握，进行延长相应时间，可以调整为10-20分钟。较多病人使用药物以后可以感觉到肛门的疼痛感相比以前会大大减轻，另外通过药物亦可以起到促进愈合、减少出血、消除水肿的作用。