泌尿系结石有种族遗传易感性和家族遗传易感性。种族遗传易感性一般认为是黑色人种泌尿系结石的发病率比其它人种，特别是比白色人种要低。黑色人种泌尿系结石的发病率低的原因，目前还不是特别清楚。另外一种是家族遗传易感性，有些遗传缺陷或疾病的个体会出现易患泌尿系结石的倾向，这是一种对泌尿系结石的遗传易感性。遗传病学调查研究发现，泌尿系结石的发病有明显的家族倾向，有家族史的泌尿系结石患者，结石的发病率比没有家族史的要高的多。有些尿石症已经明确为遗传性疾病，如胱氨酸尿症和原发性高草酸尿症都是常染色体隐性遗传性疾病。原发性远端肾小管酸中毒，其是一种常染色体显性遗传性疾病。另外，引起尿酸盐结石的痛风症、原发性黄嘌呤尿症也是遗传性疾病。