脚关节疼痛的原因如下：1、畸形：患者本身有拇外翻畸形或扁平足畸形，由于脚弓或脚趾形态改变出现异常受力，导致局部滑囊炎，引起脚关节疼痛的情况；2、劳损：脚关节是行走或负重的重要关节，长期承重或运动后易出现关节疼痛，主要表现为关节滑膜水肿。疼痛和水肿会随运动的加重而加重，休息一段时间可缓解，但严重劳损可能包括韧带撕裂或局部的微小骨折；3、退变：脚关节疼痛可能和年龄有关，随年龄增长出现关节的退变，有骨质疏松和局部骨刺生长，引起慢性炎症，导致疼痛；4、痛风：易引起脚关节疼痛，表现为局部痛风石沉积，有按压痛。