学生头疼的原因有以下几种：1、原发性头疼：非器质性疾病引发的头疼称为原发性头疼、偏头疼、紧张性头疼、冲击性头疼均较常见。学生头疼最多的原因是与用脑过度、没有充分休息导致的过度劳累引起的头疼，所以避免过度劳累引起的头疼很关键，且焦虑、抑郁有时也可引起头疼；2、继发性头疼：可能是全身性疾病，也可能是颅内外器质性疾病，如发烧引起的脑膜炎、脑部肿瘤、头颅外伤。