肚子疼即腹痛，跑完步腹痛，可能有以下几个因素：1、肠道功能紊乱：一般为小肠功能紊乱，在跑步时颠簸造成肠子异常活动，若本身存在功能紊乱，可能引起腹痛。当植物神经紊乱，跑步时内脏神经功能发生紊乱，也会引起腹痛；2、泌尿系结石：如肾脏结石、输尿管结石。当患有肾脏结石时，跑步时结石进入输尿管内，到输尿管狭窄部发生卡顿，会引起剧烈的腹痛。甚至患膀胱结石时，在跑步时结石可能存在活动，也会引起腹痛。除此之外，还要考虑肠管有没有扭转，跑步的时候如果小肠有扭转，也会引起腹痛。除肠管正常的扭转之外，剩下的就看看腹腔里面有没有其他疾病，比如肿瘤、占位性的疾病。当跑步的时候，由于肿瘤的位置、形态，可能会发生一定的变化，引起腹痛。