鼻窦囊肿破裂流黄水通常可以自愈，若鼻窦囊肿比较小，则患者无需进行手术治疗。但若患者出现鼻窦胀痛或鼻子周围不适，以及头痛、头昏沉、流黄鼻涕等症状，也可以进行手术治疗。在手术切除时应尽量将囊肿整块切除，但可能无法彻底切除，甚至会将囊肿刺破导致其中的液体流出。但即使在术中将囊肿碰破，也应将囊肿的囊皮清除干净。部分鼻窦囊肿的患者，可能会由于某些原因导致囊肿自行破裂，囊肿内的液体会顺鼻窦流到鼻腔中。若发生上述情况，患者也无需过于担心，可以暂时观察。虽然囊皮未完全清理干净但可能会在鼻窦内自行痊愈。部分患者可能会出现囊肿复发的情况，所以需进行定期随访观察。