衣原体感染为一种特殊类型的感染，通常尿路系统或生殖系统感染是指细菌感染。如果出现衣原体感染是指细菌外的病原体感染，与细菌感染存在不同之处。衣原体感染类型可能也在泌尿系统或生殖系统中，但是治疗、表现等可能会有不同。衣原体在生殖道发生感染，通常比在泌尿系统发生感染较为常见，可能会使用覆盖衣原体类药物，例如大环内酯类药物等，针对性治疗效果较好。在进行治疗中，有时会让患者进行病原学检查，比如尿液或生殖道分泌物的衣原体培养。如果明确为衣原体感染，可进行针对性用药治疗。