糖类抗原12-5即为CA12-5，糖类抗原19-9即为CA19-9。巧克力囊肿是发生在卵巢的良性疾病，可以导致CA12-5、CA19-9等两项肿瘤指标升高，通常升高幅度并不明显。而随着巧克力囊肿及时给予切除手术，这些指标可能会恢复正常。但巧克力囊肿并非一定要做手术切除，因为其属于良性疾病，若临床上无症状，可以仅做观察，暂时不给予治疗。但多数巧克力囊肿患者会发生囊肿破裂或蒂扭转等情况，这属于临床急症，需要及时给予手术来进行治疗。在大多数情况下，巧克力囊肿癌变的可能性并不大，但同样可能会导致部分肿瘤指标升高，如CA12-5和CA19-9，但这种指标的升高并不意味着巧克力囊肿已经癌变，而只是提示巧克力囊肿的存在。