肝内胆管结石的复发与采用的治疗方式、结石病因、患者身体状况有关。手术治疗肝内胆管结石不彻底，没有解除结石的病因，术后较容易复发。另外根据患者结石成分，如胆色素结石，与胆管的合并感染、炎症有关。胆固醇结石与身体产生过多胆固醇排泄有关。如果进食过多胆固醇高的食物，例如油腻饮食、鸡蛋蛋黄等，容易造成体内的胆固醇排泄增多，从而引起结石复发。 所以应该规律饮食，减少动物性胆固醇摄入，有利于减少结石的复发。利胆药物例如熊去氧胆酸，消炎利胆片等可以稀释胆汁，增加胆汁里的固体物质溶解性，从而防止患者术后结石复发。