阴茎发臭的常见原因包括以下几种：1、龟头癌：最为常见，病人发生龟头恶性肿瘤时会在龟头表面形成局部破损，出现组织坏死，龟头、阴茎表面会形成脓性分泌物，病人会出现阴茎发臭症状；2、包皮龟头炎：由于包皮、龟头反复发炎，导致包皮垢产生。包皮垢是由包皮、龟头脱落细胞和细菌、致病微生物共同形成，包皮垢中含有刺鼻性气味，会出现阴茎有臭味症状；3、急性尿道炎：病人发生急性淋菌性尿道炎时会导致尿道黏膜破损，尿道黏膜出现水疱、脓疱。水疱、脓疱破裂后会形成脓性分泌物，病人会出现尿道刺痒、刺痛和尿道外口分泌物，分泌物在包皮、龟头之间，形成阴茎发臭症状。病人出现上述症状时，需及时到男科或泌尿外科就医。