脑干出现软化灶，提示在脑干发生小血管闭塞，多见于穿通动脉的细小分支闭塞。血管由于小血管病或者其他原因，导致穿通动脉闭塞，穿通动脉给远端供血的脑细胞，由于未得到血液供给发生缺血、坏死。坏死的细胞被血液的吞噬细胞吞噬，从而形成空腔。大脑处于脑脊液中，形成空腔后脑脊液渗透到空腔中。上述患者做CT和核磁检查时会发现脑组织中存在空腔，空腔充满脑脊液，检查报软化灶。如果软化灶发生在脑干，检查报脑干软化灶。