扁桃体炎的抗生素选择很重要，关乎其疗效、反应等，头孢克肟最好不要作为首选抗生素。头孢克肟虽然是第三代头孢类抗生素，但是对于化脓性扁桃体炎的作用不大，患者应首选青霉素类抗生素。 如果青霉素类效果不好，耐药性较大，要及时更换头孢类抗生素。头孢类抗生素最好选择第二代，第二代头孢类抗生素也分为好几种，建议首先考虑头孢呋辛注射用抗生素或口服抗生素。这类抗生素对球菌的效果比较好，比较符合导致扁桃体发炎的细菌，而头孢克肟最好不要作为首选药。