儿童切除扁桃体的危害，常见以下几种：1、手术风险：儿童扁桃体切除毕竟是手术，所以其有一定的风险，所以一般不到万不得已时，不会做扁桃体切除手术。而且扁桃体切除术一般要全麻下做，所以有一定的手术风险，手术以后创面有一定比例的出血问题；2、免疫力下降：扁桃体毕竟是免疫器官，所以在扁桃体切除术后，儿童可能在短期内出现免疫功能下降。可能表现为有儿童患有感冒时，手术后的儿童与感冒儿童一块玩，比较容易感染，感染后症状往往比较重，如发热时间会比较长、体温比较高。但通常过段时间以后，儿童的免疫力就会恢复。因为人体中起免疫功能的还有其他脏器，所以一般不会因为做扁桃体切除术，儿童就会出现永久性的免疫功能缺陷。