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核磁共振适合于人体绝大部分部位的检查，比如利用核磁共振可以检查头部、颈部，还可以检查人体的小器官，比如甲状腺、乳腺，可以做胸部的检查，也可以做腹部脏器的检查，比如肝脏、脾脏、胆囊、胰腺以及肾脏的相关检查。
核磁共振还可以用于妇科的检查，比如当患者有子宫或者卵巢的疾病时，也可以选择核磁共振。身体其他部位的软组织病变，也会选择核磁共振进行检查。当患者有脊柱的疾病，比如颈椎、胸椎、腰椎间盘的突出，或者是椎体的其他病变时，也可以选择做核磁共振。
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