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核磁共振出现异常信号时则提示该部位组织内的细胞成分、比例发生改变，也可能是其他组织替代了该组织，但也存在生理变异的可能。核磁共振的原理是利用特定射频脉冲激发处于静磁场中的人体氢原子核，进而发生的磁共振现象，通过专业设备进行最终成像。
核磁共振的异常信号通常代表了该部位出现炎症、缺血、出血、梗塞、肿瘤等。核磁共振的每个序号都代表着不同的意义，核磁共振检查则是根据这些信号的改变来判断是否病变，如DWI高信号，可能是炎症、肿瘤或梗塞。建议患者在出现异常信号时积极接受治疗，定期接受复查。
核磁共振的异常信号也有可能是正常的生理性钙化引起，如颅内钙化，包括松果体、小脑齿状核、基底节苍白球、脑室脉络丛等，显示为T1和T2双低信号，一般不需要进行干预治疗。
此外，核磁共振检查没有放射性，是利用磁场进行成像，是一种安全的检查。但是金属可能会对磁场产生干扰，所以进行检查前，需要将手表、项链等金属摘下，带有心脏起搏器、支架、钢钉等患者，不可以进行核磁共振检查，妊娠期3个月内的孕妇最好也不要进行。
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