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四维彩超检查能够排除一部分的神经缺陷，也就是能够发现一部分的胎儿神经系统畸形。
神经系统的畸形是超声最早用于产前诊断的疾病之一，超声可以根据典型的声像图特征，来诊断一部分的中枢神经系统的畸形。比如四维彩超可以看到胎儿是否有脑积水。如果有脑积水，超声下会看到胎儿的一侧或者是双侧的脑室扩张。
超声还可以用来排查胎儿是否有脑膜膨出，或者是脑膨出，也可以判断胎儿是否有无脑畸形以及颅脑畸形。另外常见的神经缺陷就是脊柱裂，超声也可以进行判断。
但是四维彩超并不能够排查所有的神经系统的缺陷，因为超声毕竟是一种影像学检查方式，有一定的局限性，不可能显示胎儿的所有问题。即便四维彩超发现胎儿的神经系统结构是正常的，但是孩子出生之后也有可能会出现功能的异常。所以，定期做产前的超声，来观察胎儿的早期以及晚期的畸形，是非常重要的。
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