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鳞癌潜伏期也就是从正常鳞状上皮发展到鳞状细胞癌，所需要的时间时10-20年左右。癌的发生是长期且有多因素参与的分阶段的过程，要使细胞完全恶性转化，需要多个基因的改变，包括多个癌基因的激活、肿瘤抑制基因的失活以及凋亡调节基因和DNA修复基因的改变等。
鳞状上皮非典型增生属于癌前病变，表现为细胞大小形态不一、核增大、核浆比增高、核分裂象增多、细胞极性紊乱等。根据非典型增生病变程度分为两级，低级别非典型增生和高级别非典型增生。非典型增生不一定都发展为原位癌乃至浸润癌，大约一半的轻度非典型增生可自然消退，仅有不到2%的轻度非典型增生最终发展为浸润癌。发展为原位癌的几率和所需要的时间，与非典型增生的程度有关，病变级别越高，其转化几率就越高，所需时间也越短。所有非典型增生发展为原位癌的平均时间大约为十年，至少有20%的高级别上皮非典型增生，在十年内发展为浸润癌。如果适当治疗，绝大多数非典型增生可以治愈。
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