卡肺往往鉴于免疫抑制的患者，如进行器官移植，后期使用免疫抑制剂，或者本身有免疫缺陷的疾病，如艾滋病这类原发病的患者，容较易并发机会性的感染。一旦感染发生，最突出的表现是发热，大多数患者都存在发热，除发热外，通常具有呼吸困难，即缺氧，发比较迅速。再者有咳嗽、咳痰、胸痛等相应感染的表现。影像学上主要是腹泻，间质性肺炎的改变，即复发的间质性肺炎浸润，需做特殊的荧光染色，取肺泡灌洗液或者痰液，可以确诊。