传染性软疣和扁平疣在病因、症状和治疗方法上有明显差别。
1. 病因：传染性软疣是由传染性软疣病毒感染局部皮肤所引起的疾病，而扁平疣则是人乳头瘤病毒感染局部皮肤所引起的一种疾病。
2. 症状：传染性软疣患者可能会出现3~5毫米大小的半球形丘疹，凸于皮肤表面，最初质地比较坚硬，随着病情的发展，会变得比较柔软。扁平疣患者可能会出现扁平丘疹，米粒大小，呈现圆形或多边形，表面比较光滑，质地较硬。
3. 治疗：传染性软疣的患者可以在医生的指导下使用西多福韦软膏、咪喹莫特乳膏等药物进行治疗，可以有效地抑制病毒，促进愈合，也可以通过电疗法的方式来消灭局部皮疹。扁平疣的患者可以遵医嘱使用水杨酸软膏、维A酸乳膏等药物进行治疗，也可以通过激光的方式进行治疗。
总的来说，传染性软疣和扁平疣在多个方面存在显著差异，如有疑问建议咨询专业医生，在医生的指导下进行相应处理。
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