两个腋窝的体温不一样可能有以下原因：
1. 生理因素：这可能是测量失误或者两侧肢体的活动量不一致导致的。
2. 疾病因素：单侧腋窝发生过敏性皮炎、淋巴结发炎都可能导致局部皮肤温度升高，伴有瘙痒、渗出、肿块等症状。
3. 内因：不同的人体温有差别，同一人不同时间体温也不一样，同一人同一时间不同部位温度也可能不一样。
4. 外因：环境因素（如右手烤火，左手放在冰块上）也可能导致两侧腋窝温度不同。
5. 误差：即使是同一部位，也很难测得一样的温度，比较精确的温度要多次测量后取平均值。
综上所述，如果两个腋窝的体温不一样，建议多次测量以取得更准确的温度。如果症状持续或发热，请及时就医。
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