聚肌胞注射可以用于治疗扁平疣。扁平疣是由人乳头瘤病毒感染引起的病毒性皮肤病，好发于青少年，故又称青年扁平疣。大多数扁平疣突然出现，为米粒到绿豆大小扁平丘疹，表面光滑，呈圆形、椭圆形或多角形，质硬，正常肤色或浅褐色，界限清楚且数目比较多，散在分布或沿抓痕呈条状分布，好发于面部前臂及手背等处，一般无自觉症状，偶有微痒，病程慢性有时可突然自然消退，但也有持续多年，愈后不留瘢痕。
聚肌胞是一个免疫调节剂，可以诱导体内产生干扰素，对多种病毒的治疗都有很好的疗效。聚肌胞注射通常作为扁平疣的辅助治疗手段，也可以与其他治疗方案联合使用，如局部外用药物，包括维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等，或者选择物理方法，如二氧化碳激光、液氮冷冻等。
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