金黄色葡萄球菌毛囊炎可以使用以下药物进行治疗：
1. **口服药物**：可以选择口服的盐酸米诺环素、多西环素等四环素类的药物，也可以选择口服甲硝唑片、阿莫西林胶囊等，这些抗生素能够抑制金黄色葡萄球菌的代谢和繁殖，从而由内而外的使局部的毛囊炎症逐渐得到控制，使局部化脓、压痛等症状逐渐好转。
2. **外用药物**：在局部皮肤表面也要应用一些外用的抗生素类的药膏，可以在表皮涂抹莫匹罗星软膏，也可以选择涂抹夫西地酸乳膏，这两种药物有助于抑制金黄色葡萄球菌的增殖，使其活动度逐渐降低，从而使局部的炎症性改变逐渐消失，达到辅助治疗的效果。
需要注意的是，以上药物需在医生的指导下使用，切勿擅自调整用药或停药，以免导致治疗不彻底。在治疗期间，日常饮食尽量清淡，避免食用辛辣刺激性食物，同时注意皮肤清洁，尤其是在外用药膏之前建议先清洁皮肤，避免影响药物疗效。如有任何不适，请及时就医。
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