扁平疣患者可以使用抗病毒药物，包括阿昔洛韦片、泛昔洛韦片、盐酸吗啉胍片、利巴韦林片等，以及外用药物，如喷昔洛韦软膏、干扰素软膏等来抗病毒。还可以口服转移因子口服液或胸腺肽口服液，或肌肉注射草分枝杆菌注射液、卡介菌多糖核酸注射液来提高免疫力。
建议在治疗过程中，注意局部皮肤的清洁，避免导致继发感染，并保持良好的个人卫生习惯。坚持体育锻炼，增强体质，提高机体抵抗力，这样有助于疾病的恢复。同时做好病情的监测，监测有无其他不适症状，一旦发现身体不适，及时就诊。
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