杭锦旗蒙医综合医院成立于1979年，经过多年的发展，已成为一所设备齐全、人才济济、功能齐全的民族科研医疗机构。医院以蒙医药为主，西医为辅，集临床、科研、教学、蒙药制剂为一体，是本地区唯一的“二级甲等”非营利民族综合医院。

医院占地面积40102.56㎡，总建筑面积12984.08㎡，拥有146张床位。职工总数为120人，其中包括高级职称31人、中级职称26人以及初级职称59人。医院设有多个临床和医技科室，包括肝胆科、肠胃科、内一科、内二科、外科、五疗科、风湿科、妇产科、急诊科、治未病科、蒙医心身医学科、手术麻醉科等。

杭锦旗蒙医综合医院特色之一在于其蒙医药的发展与应用，特别是五疗科，采用蒙医五疗药浴技术治疗多种疾病，如风湿病、类风湿病、皮肤病等，以其独特的蒙医传统疗法深受患者好评。

医院不仅在医疗服务上取得了显著成就，还获得了多项荣誉，如“鄂尔多斯市文明单位”“药品抽检无假药单位”“先进党支部”等称号。2014年，医院更被国家中医药管理局评定为二级甲等民族医院。

杭锦旗蒙医综合医院以其深厚的蒙医文化底蕴、先进的医疗设备和优质的服务，为当地及周边地区的患者提供了高质量的医疗服务。